1992年にブラジルで開催された環境と開発のための国連会議（地球サミット）で発効された生物多様性条約に基づき、2000年に採択された議定書で、正式名称は「バイオセイフティに関するカルタヘナ議定書」。議定書は、バイオテクノロジーによって改変された生物（ＬＭＯ）が、生物の多様性の保全と持続可能な利用に及ぼす可能性のある悪影響を防止するための措置を規定している。国境を越える移動に焦点を合わせて、ＬＭＯの安全な移送と取り扱い、利用において十分な水準の保護を確保することを目的としている。また、生物多様性の保全及び持続可能な利用に悪影響を及ぼす可能性のあるすべてのＬＭＯについて適用されるが、人のための医薬品などについては適用されない。議定書では、輸入国が該当生物の輸入の可否を判断できる輸入手続や事前合意手続が不要なＬＭＯ、輸出手続、添付書類、締約国内のリスク管理・緊急措置、能力開発、公衆の啓発及び参加、不法な国境を越える移動などに関する事項が規定されている。
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